Folding@Homeで難病解明 Part18【FAH】
Folding@homeは、タンパク質がどのように自力で組みあがっていくか(folding)を
シミュレートし解明する分散コンピューティングプロジェクトです。
アルツハイマー、がん、狂牛病、パーキンソン病などはタンパク質の異常なfoldingが
原因と考えられており、foldingを解明することはこれらの疾患の解明につながります。
みなさんのコンピューターの余力を使って、タンパク質のfoldingという複雑な問題を解明しましょう。
現在、新型コロナウイルスに対抗するための解析を重点的に行っています。
■前スレ
Folding@Homeで難病解明 Part17【FAH】
https://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1633043818/
Folding@Homeで難病解明 Part16【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1613357806/
Folding@Homeで難病解明 Part15【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1604733903/
■当スレッドのチーム
チーム名 ：Team 2ch
チーム番号：162
https://stats.foldingathome.org/team/162
まとめWiki
https://team2ch.net/
■Folding@Home公式
https://foldingathome.org/ ■Folding@Homeの参加方法
1. アプリのダウンロード＆インストール
https://foldingathome.org/start-folding/
OSは、Windows(32bit, 64bit)、Mac(macOS 10.7以降)、Linux(64bit, rpm or deb)に対応。
2. ユーザ登録
https://apps.foldingathome.org/getpasskey
名前とEmailアドレスを登録して、Passkeyを入手する。
・ユーザ登録は必須ではなく、匿名ユーザとして貢献できるが、獲得ポイントは下がる。
名前は https://stats.foldingathome.org/donors で検索して重複しないことを確認。
・名前で使える文字は、英文字、数字、下線(_)である。特に「＃^?|」は不適。日本語も避ける。
3. アプリを開始して名前・チーム番号・Passkeyを登録
チーム番号に162と入力するとチーム2chのメンバーに入れる。 ■TIPS
Q. タスクが落ちてこない
A. passkey登録する 一時停止→開始ボタン
Q. GPUが仕事しない、計算ミスる
A. クロック電圧は余裕をもった設定で
Q. CPU使用率が上がらない
A. 現時点の利用可能論理コア数は32コアです
☆高速CPU/GPUを使っていたら Next Unit Percentageの設定をしておくと良さそう
Advanced Control > Configure > Slots > (Slotを選択) > Edit > Addボタン
name に 「next-unit-percentage」、Valueに90から100の数字を入れる
デフォルトが99で、WUの処理が99%まで進んだら次のWUのダウンロードが始まるという設定。
95とかにすれば、WUの処理が終わったのに次のWUが落ちてきてない、ということを抑制できるはず。
☆標準では1つの課題にCPUの全スレッド-1（Fullの場合）を適宜割り当てて対応するようになっているが
configure→slots→Addを押して出る「CPUs」の所の数値「-1（自動割り当て）」を「1」や「2」にしてOKを押すと
CPUスレッド使用数を限定して課題を処理できる。
同時に、現在はこのスロット数を増やしている方が課題が落ちてきやすい。
（GPU側は詳しい人以外はそのままで）
☆リモートの方法
1、サブPCのAdvanced Control > Configure > Remote Access でPasswordを決める
2、IP Address Restriction に 127.0.0.1 （メインPCのIPv4アドレス）/24を入力（例：https://imgur.com/40YNkiO）
3、メインPCに戻り、Advanced Control > Clients > Add > Address > HostnameにサブPCにのIPv4アドレスを入力
4、アプリ再起動
☆コマンドラインで、FAHClient.exe --helpを実行するとオプションを閲覧できます。 ■Folding@Home公式
・トップ
https://foldingathome.org/
・フォーラム
https://foldingforum.org/index.php
・FAQ
https://foldingathome.org/support/faq/
・ダウンロード/ベータ版
https://test.foldingathome.org/beta/
■ランキング
・全チームランキング
https://stats.foldingathome.org/teams
・Team 2chメンバーランキング
https://apps.foldingathome.org/teamstats/team162.html
・EOC Folding@Home Stats
https://folding.extremeoverclocking.com/
・各GPUの1日獲得ポイント表 GPU PPD Database
https://www.overclock.net/forum/55-overclock-net-folding-home-team/475163-gpu-projects-ppd-database.html
・外部の統計サイト
https://folding.extremeoverclocking.com/team_summary.php?s=&;t=162
・Windows版でオプションの入力が何故か半角カナになってしまうときは、マウス右クリックのペーストを使うか、変換入力状態にしてF10で英数に変換する
・WUのDL/ULが失敗し続けて待ち時間が数十分とか数時間とかになっているのに気づいたら、いったんPauseしてFoldし直すと待ち時間をリセットできる
・とはいっても、サーバー側でWUが枯渇したり受け取り口がパンクしていると思われるので、基本的に気長に待つ
・Advanced ControlのFolding Slotsの各スロットを右クリックすれば、スロット単位でFold/Pause/Finishができる ■プロジェクト稼働状況
https://apps.foldingathome.org/
-ステイタス: サーバ, WU
-パスキー: 生成と再取得
■ユーザー WU提出状況 (直近90日間)
https://apps.foldingathome.org/cpu
-User欄にユーザ名を入力し、[Search]ボタンをクリックする
-CPUid, IPアドレス, Team, CPU種類, OS種類, 最終提出日時やプロジェクト
■Team 2ch 活動状況
https://folding.extremeoverclocking.com/team_summary.php?s=&t=162
https://stats.foldingathome.org/team/162
-メンバー, 獲得ポイント, WU数
■CPU/GPU パフォーマンス統計
・CPU FOLDING@HOME PPD RANK DATABASE
https://folding.lar.systems/cpu_ppd/overall_ranks
・GPU FOLDING@HOME PPD RANK DATABASE
https://folding.lar.systems/gpu_ppd/overall_ranks ツイッタにFAHに関連する最新の論文が示されていたので簡単に紹介。
アルツハイマー病の危険因子であるタンパク質ApoEの構造解析にFAHが使われた。
この研究結果は、ApoEがプラークの沈着や神経原線維の形成に与える影響を研究する基盤になるだろう。
掲載されたPNASは有名な雑誌。
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2215371120
Apolipoprotein E4 has extensive conformational heterogeneity in lipid-free and lipid-bound forms (アポリポタンパク質E4は、脂質を含まない状態と脂質が結合した状態で広範な立体構造的の不均一性を持つ)
大ざっぱな内容
アルツハイマー病の最も強力な遺伝的危険因子ポリポタンパク質E(ApoE)の生化学的特性と疾患におけるその役割の関係は、利用可能な構造情報が限られているために捉えられなかった。本論文では、病原性アポリポタンパク質ApoEの全長について、脂質の存在下および非存在下での単量体の特徴を明らかにした。本研究では、1分子分光法と分子動力学シミュレーションを組み合わせて、ApoE4単量体の原子レベルの詳細なモデルを構築し、脂質結合の影響を調べた。この手法により、単量体のみが存在するピコモル濃度での研究が可能になり、これまでの限界を克服した。脂質結合の影響を調べるため、FASTアルゴリズム(GROMACS)とFolding@homeシミュレーション(OpenMM)の分子シミュレーションを組み合わせて、ApoE4単量体の原子レベルの詳細なモデルを構築した。 >>1乙
4000番代導入してみたけどやっぱりめっちゃ速いな
なお自宅ゲームは3060… しっかり10年sandyおじさんをやってた自分的には
3070で10年やっていけそうな手応えを感じている TDP65WのRyzen 9 7900のワッパがめちゃくちゃ高いみたい。
省エネハイパフォーマンスのCPUとしてF@H回すなら最良の選択肢の1つだと思う。
この記事の下の方にあるCLUB386 EFFICIENCY RATINGがワッパだが、
次点がZen4でもRaptorLakeでもAlderLakeでもなくZen3のRyzen9 5950Xというのも驚き。
https://www.club386.com/amd-ryzen-9-7900-review-big-on-performance-miserly-on-power/ 4070tiパワーリミット45%に設定しても
PPD/日600-1000万出るかなcancerだけは重くて性能は出にくい
が409040804070順番通りでしっかり
性能差は出てるからどれ選んでもいいと思う
消費電力はPL掛けてGPU単体で120から130wくらい…
今ある2枚売って一枚4000シリーズに変えるだけで随分時間も電気も負担が減るわ
ただGPUのレールパワーって項目は3000番代でみたことない
400W近いのをPL無しだと出てたりするので下位モデルでも規定通りに750Wは積んでないと不安かも
PL掛けてれば最大で150wとかに落ち着くけど起動時はわからんしなぁ RTX系よく使う人多いけどTeslaとかで回してる人いないのかな？ 久々にCPUでもと思ったら
ｽﾘｯﾊﾟなのに1日半の固いのがｷﾀ
まじか(￣｡￣;) 性能抑えて回してたら7日級が来た
フルパワーでも間に合わないや BCが120000とか頭おかしい
＠CANCER Project 18717 v8クライアントのベータが出ましたね
アプリとしてのAdvanced Clientは無くなった模様
https://foldingathome.org/beta/?lng=en
あくまでベータ版なので、試す場合はお気を付けを >>21
情報ありがとう。スロットの概念がなくなって、FAHプロジェクト側がCPUやGPUをジョブに応じて割り当てられるというのは大きな変化だね。 ベータ版で計算効率というかPPDがどう変わるか気になる
試した人はぜひ聞かせて PPDは表示されないね
一個ずつ止めたりできんしwebコントロールは好かんので戻そ >>24
サンクス。自分は試してないけど、とりあえず調べた結果を簡単に書く。
公式フォーラムにもPPDが見づらいというスレが立っていた。
それによると『グラフィックビューを表示』すると見えるそう。
PPD was hard to find
https://foldingforum.org/viewtopic.php?t=39047
PPDの表示については開発者に改善要望が送られてるけどまだオープンのままだった。
Show PPD & TPF on WU line
https://github.com/FoldingAtHome/fah-web-client-bastet/issues/55
他に、『HFM.NET』というWindowsアプリも述べられていた。配布元と思われる
Githubサイトのリリースノートにv8クライアントへの対応は記載されてなかったので何とも。
HFM.NET - Client Monitoring Application for the Folding@Home Distributed Computing Project
https://github.com/harlam357/hfm-net >>20
こればっかり落ちてきて全然進まなくなったなー
まあ別に良いんだけど >>26
俺もそればっかり落ちてくるようになったからF@Hをとめたわ
どっかの企業らしいが自前でやれっていう ぜんぜん気づかなかったが、企業の仕事がF@Hで行われてるの? 新型コロナのワクチンでもF@Hを使ったシミュレーション結果は多分使われてるだろうな
新薬開発って膨大な時間と資金が必要だと思うし
大流行してからあんな短期間でワクチンなんて普通は作れないだろ でもmRNAは、どうなのよ？
陰謀説とかあるけど、まぁ真相は闇やね
全然関係ないけど、AMDのｸﾞﾗﾎﾞのコアの？呼び名？
みたいなワクチン名だよなw
もう、いきなり暖かくなり、そろそろ
電気代もたけーし、また秋頃の涼しくなったころまで、止めるかな。 モデルナやファイザーのmRNAワクチンは、ウイルスの現物から解析されたスパイクタンパク質をもとに作られた。
だから素早く薬剤として供給することができたし、分子シミュレーションの成果は直接に結びついていないと思う。
みんな関心のある、ボランティアベースの分子シミュレーションでゼロから設計されたワクチンは、
Rosetta@homeの成果がワシントン大学からライセンスされて作られたSKYCovioneが昨年承認されたし、
Folding@homeが関与したMoonshotプロジェクトの成果が第三相臨床試験にはいったと2カ月くらい前に書かれていた。
でも、新型コロナの経験で新しい創薬プロセスが大きく進んだのは間違いないと思う。 GPUアーキテクチャ名に似てるんじゃなくて、AMDがRNAにひっかけただけだよ 16705 no infoみたいなのずっと解いてるけど
何やってんのかな
なんか大丈夫なのかなぁ心配になってきた apple siliconには結局対応しないのかね >>36
一応、次バージョンのクライアント(>>21)だとIntel or Apple Siliconとなってるね
あと、v8のベータ版はわりと頻繁にリリースしてる模様
https://github.com/FoldingAtHome/fah-client-bastet/blob/master/CHANGELOG.md
(変更歴の方はgitにしか無いのも記載されてる) 電力料金がこれまでより高くなったこともあって、FAHを止めるか悩んだ。
うちは東電の管轄下だが、「くらしTEPCOweb」という電力サービスで調べてみた。
グレーの電力量計が30分毎に実績を送信しているようで、30分毎にどれだけ電力を消費してるかや、1日あたりの電気料金が翌日に調べられる。
昨日の実績を見ると、寝てる時間帯や不在時の電力は一定で、帰宅して暖房を入れたら跳ね上がったりと、体感とも一致してる。
気になったのは全体の1/3を占めているベースの部分で、常に約100Wの消費があって、うち50WはFAHを実行してるノートPCやラズパイで説明できるが、残り50Wは不明。これだけで月あたり1000円かかるから、特定して電気代を減らせるかもしれない。
内訳を知ることで、冷蔵庫・暖房・照明を何とかしたいな、といった気づきを得られた。FAHは1000円/月のうちは続けるよ。 カウント前後の一時間ぐらい冷蔵庫のコンセント抜いてみて
その後さしてみて比較するとか >>39
コンセント挿して電源入るの待機してる機材の
積み重ねなんじゃね？台あたり0.5Wから多いもので
5Wくらいかかってるんじゃなかったっけ パケ詰まりに対応して欲しい
寝ているときにアップを始めても回線切断を繰り返して
なぜかダウンもされないので電気の無駄になる
ルーターの再起動をして多少まともになったかと思ったが
結局ダメだった(ログなどを見たら数10MBの通信で詰まったようだ)
Dの安SIMと国内メーカーのルーターの組み合わせ
ADSLのときは起きなかった現象(雨や雷がおさまるのを待っていた) >>43
>Dの安SIMと国内メーカーのルーターの組み合わせ
対応しないといけないのはお前の環境の方じゃ？ そういうのいらないですよ
なんの解決にもならないのは
このスレは次回ﾜｯﾁｮｲありの方がいいね ADSLの時は起きなかったって自分で言ってるじゃん。
>Dの安SIMと国内メーカーのルーターの組み合わせ
これが原因なのは明らかでしょ。
自分を含め他のほとんどの人の環境ではパケ詰まりなんて起きて無いし。
あなたの環境を変えるという解決策を提示してもらっても実行せず、指摘してくれた相手を邪魔者と決めつけ、
F@H側に原因があるとするあなたこそ、ワッチョイ付いたらあぼーんされる側だよ。 パケ詰まり(止まり)はキャリアも認識しているし
でも今さらリジュームにすら対応していないサーバはどうかと思うわ。
一番バカなのは人の環境を変えろって暴言だわな。 バカって言う人がバカなのよってママンに教わらなかった可哀想なハゲ また解決策も出せずに暴言を繰り返すだけ
本当に頭が悪いw >Dの安SIM
って事はビジネスノートでやってんの？
CPUに負荷を掛け過ぎて処理出来てないんじゃねーかな
でも一番怪しいのはやっぱ国内メーカーのルーターっていう部分
国産だからと言って高性能高品質なんて都市伝説だぜ？
無線じゃなくケーブル直繋ぎでも起こるなら・・・分かんね しばらく回さないからいいほうのGPUをゲーム用pcに戻そうかなぁもう一枚40シリーズ買えればいいんだがそんな余裕はないんだよな… 最近16566または1657nという番号の課題が配布されていて(GPU)、こちらは上位GPUでポイントが伸びる
PPDの出ないがんの課題と比較すると、自分の環境では約2倍のPPDになっている GPUのみで参加してるがWU何やってももう8h近く降ってこなくなった
昨晩のログちゃんと見てから始めれば良かったが再起動してから始めちゃったので確認もできないし もう一台のpcでもf@hのクライアント接続出来なくなっちゃった
edgeのなんか変わったんだろうか？おま環かなぁ 全然ダメになったセキュリティアプリが警告出すようになったので許可リストに移動
Windows10最新edge最新アドブロックplusとアドブロック入れてるがオフっても変わらず
gpu見失って赤いスマイル君出てる f-secureのブラックリスト入り絡みだったみたい
どう解決して良いかわからない… ワイもGPUで演算できなくなったわ。runningの表示は出てるけどずっと0%のまま。どうなってんだ？ f@h advanced controlの方も見てみるとWU落ちてきてないなら
GPUが悪いわけじゃなくサーバー接続の齟齬かなんかでWU割り振られてないだけかも
これだけなら時間置いてから再接続で大丈夫だと思う f-secureで許可リストに載せ数日したら動くようになった
もしかしたら数日待つだけでも動いたかもしれんが弄った設定類は元に戻したくない f@h立ち上げるとブロックノイズが出るようになったな
ゲームやアマプラ見てもでないけどf@h待機してると
計算してない時も定期的に出る… やっべ、構成メモリ増やした程度なのにCPUGPU両方でやるとPC落ちるようになった
しかしなんか落ち方変なんだよなぁ
メモリのLEDやらケースファンは回りっぱなしでPCの電源が落ちる cドライブにインストールした場合cドライブのストレージに毎秒細かくリードライト繰り返してるのってF@Hのアプリだよね？
他ドライブにインストールして負担を分散できるんかな？OSストレージだけ無事に（まあ今どきのSSDは高耐久だけど）他に散らしたい >>68
x470とかだとbiosで必須経由&該当 bios時にOSからマザボのファームウェア当てないと
メモリ最小構成以外うまく回らずトラブル出るやつあるらしいよ
ファンがブーンて回りっぱなしってbiosっぽいかな？
俺のギガx470もbios一個ずつ上げて面倒だった 追伸。公式フォーラムにRAMディスクにFAH一式を移動できないか、という書き込みがあった。その中に、
ある人は、ドライブへの書き込み量は32GB/日で、1TB/月という見積を書いてる。
https://foldingforum.org/viewtopic.php?p=352398#p352398
もし自分のSSDが許容できるなら現状のままでもいいかもしれない。まず、どの位の書き込み量があるかを測定してみては？ >>73
ありがとう
そのくらいの書き込み量なら全然大丈夫なのかもですね
下手にいじらずOSドライブ同居で良いかもしれないですね
逆に使いきれないくらいTBWあるモデル増えてるし…回しても8h環境だし >>73
>ドライブへの書き込み量は32GB/日で、1TB/月
かなり多いね。
32GB超のAAAゲームを毎日1本のペースでインストールするのと同じくらいTBW消費する。 >>75
FAHの書き込みは途中経過の保存が主なので、保存間隔を広げれば書き込み量を減らせるよ
もちろん電源を切ったときに失われる計算量は増えるので、何を優先するかだけど >>75
24時間だし6hくらいしか回さなかったら大したことないような
ゲームデータ移動とかの方が50GB×本数一瞬でクリティカルじゃない？
TBWも800tbwなんて使いきれんよ とはいえ24h WUを3、4問併行とかだとガリガリ削れるか…
高効率のGPU2枚で2台ストレージは2Tに移動みたいな方が今はいいのかもな >>72
pcの知識あまりないので誰か分かりやすく教えてくれると嬉しいです >>80
そのページはデフォルトのインストールでは不都合がある人のためのものなので、まずご自身がそういう状況にあるのかを考えてみて、
該当すると思うなら「なぜそう考えたのか」を文字にして説明してみては？ 会社から支給されたRTX3070搭載のノートを去年夏からずっとぶん回してたら突然電源切れてぶっ壊れたわw
とりあえず稼働させてたことバレないようにしなきゃなぁ。こんなんで壊れるもんなんか？ ちょっと上にもあるけど意外とストレージにも負担が掛かるみたい
グラボも無い低スぺノートで回してたらストレージが死んだ 同じ条件で回してるのに当たり引き続けた時と固い問題当たった時で半分の報酬結果になる
コレはひどい…全然稼げないなー 久々に廻しているけど、インフルエンザや液相分離のような見慣れない研究テーマも登録されてるんだね 新しいWUいくらか増えた
コロナで人口増えたけれど
今となってはトータルで動いてる人は減った
寂しいな… >>86
いま、世界中でこれまでにない熱波による異常な高温が続いてるよね。
温暖化ガスの抑止と、電力は（F@Hではなく）生存のために使われてるのではないかと思う。これは仕方ない
一方で、研究者は新しいアルゴリズムを開発して、計算機資源をより効率的に使うような取り組みもあるので
資源の最適な配分も行われるんじゃないかと、自分は期待してる。 わざわざ買ったGPU寿命削って解析ボランティアって
する人は稀か4070ti使ってるが今のところPLかけても
成績悪くないな
もう一枚予備pcには補助8ピン一本で済む4070無印買うかもしれん ほんと過疎になって寂しい
もうきっと俺と俺しかいない 俺もいるよ。でも、世界中で異常な熱波が襲っているニュースを目にして、今はマシンを止めている。
時々、F@Hサイトや公式フォーラムなどで、F@Hに関する活動や論文がないか探してる。 暑さでエアコンもろともダウンしそうな漏れ参上
秋になって冷房が不要になるまで回したくても回せねぇのが辛い 秋口から冬場は、回す予定だけど
電力会社がえげつないからなぁ糞 PLして回してるが45%にしてる（130-140wくらい
機種別参考スコア値下げてスマヌな
ゲームPCは折り畳み専だしps5買ったけど全くゲームもしなくなったし
老いに従いギターでも始めた方がいいのかもしれない
貰ったウクレレをひとときかまって
クレイジーGやや弾けるくらいの腕と情熱しかないので続く気がしない >>94
情熱よりも、後で振り返ったときに積み重ねたもの・ことが分かるような目標を見つけてはどうだろう。
自分が生きている証や、生まれてきた価値を残したいのであれば、世の中の役に立つことがいい。
そのときF@Hはまごうことなく万人のための社会貢献だと思うよ。 俺のウイルス対策アプリだとその辺の暗号通貨取引をするアプリと見做され
警戒されて脅威対象でf@hのURL全ブロックされるw
全部登録して例外許可しないといかん >>95
病気して退院後精神的に参った時
こんなことしててなんになる？って回るファンの音で滅入って
焦燥感相まって機材全部処分したくなったんよな
まあ仮に新しい趣味でギター弾いてても釣りしてても
同じように機材処分するくらい落ち込んでただろうけど >>99
何の病気で退院したのか今もそうなのか分からないがもしメンタル的な
不調を認識してるなら専門家の力を借りた方がいいかもしれないよ
カウンセリング、心療内科など >>101
精神的なものでなく普通に外科の手術でした
全身麻酔の抜けの時の影響が大きくて酷く落ち込んだ
回復してからはもう大丈夫だけど
要らない経験値が上がってしまったかもしれません
心療内科に行こうと言うほどではないかなぁ >>102
生き延びたんだから良かったじゃん。重荷になっているものは捨てて、したいことをするのがいいんじゃないのかな。
5chを含めたSNSから遠ざかるのもひとつの手だと思うよ。 うちは太陽光発電で自家消費してるので、昼間だけ計算させて、夜間はPC休めてる 良いなぁ
うちの車庫の天井にも設置したら少しは足しになるんだろか
小規模に置いてもメンテ費が高くつきそう ps3時代なんかはみんなで集束って一体感あったけど
マイニングでさえ専用施設
もう小PCパワーでたくさん演算力集めるより
個人ではどうしようもない大規模なパワーで
纏めてやった方がいい時代なのかな？
まだ個人の手助けって有効なのかなぁ
存在意義があるんだろうか… そんなネガティブ思考に陥りながら
GPUを交換した >>107
すこし考えすぎじゃないかな。確かにポイントで貢献するには高いスペックが要求されるが、
ラズパイや、dGPUのないモバイルPCも参加できるし、スペックに見合ったWUが送られてくる (締め切りはキツいけど)。
FAHの目的は、研究で新たな発見をすることと、多くのボランティアが参加してサイエンスを行うことの2つがあると思う。
それにボランティアは、手持ちのPCと電力代を提供する他にも、研究に寄付したり、ツイートや記事を書いたり、
一人一人が病気と闘う方法を見つけてるよ。 40シリーズ売れてなくて余ってるみたいだから10や
20中堅GPUで頑張ってる人はもう少しで安く高効率に
GPU交換できるかも
まあそうは言っても普通の感覚だと3-5万でも高いんだけどさ
40は安くなっても元から高いからなぁ
電気代も下がって効率はかなりいいんだけど そういうふうに稼働時間をコントロールできるなんてうらやましい。たぶんGPUタイプのジョブだね
うちではCPUタイプだが、1日で終わることはなく、2-3日はざら。しかも提出期限がギリギリに設定されてるので止めたらアウト。
もし期限を越えたら他の人にリカバーしてもらうことになるし、負担感が高くて、FAHは敷居が高い存在になりつつある。 確かにCPUは回しっぱなしでないと
時間制限厳しい問題ばかり降ってくるな 2chチーム人減りまくって動いてる人居なくなってる
マジで寂しい
でも10年前の数倍GPU性能伸びてて効率は増してるのかも…
なんとも言えない気持ち
古参が嫌になって辞めちゃう気持ちはわかるかも 10年前だとKepler世代だな
数倍どころではなく、当時のハイエンドと今の4090では50倍以上のポイント差になる 4000番は効率凄いけど価格も凄いので
長くやっててこんな金出そうとは思わないだろうな
2000番複数台世代が多そう GPU F@Hに0x23という新種のコアが登場している
今のところこの新しいコアで処理される課題はベンチマーク用のごく短いものだけのようだ
新しいコアで処理効率が上がるとよいが 連休最終日だったからか、チーム内順位のデッドヒートが凄いｗ なんか放置して見てなかったPC壊れたみたい
今週はバラす時間ないからしばらく放置だけど
原因が気になって仕方ない
件のドライバか暗に進んだOSアプデ失敗かメモリ挿しなおし
で直るか…bios入れ直しなのか…ファンがブーンで画面でない
1番やばいやつ 残念だけどコレはダメぽ一台減らします…状態から
もう一度全て組み直したらos起動までいけて
GPUドライバーDDU削除→536.23に更新で直りました
今の所以前と同じ負荷掛けてhwinfoで確認しても変化ないように見える
問題出てない
心配していただき本当にありがとうございました 1台起動して数回No WUs available for this configuration
続いて暫くして割り当てWU貰う感じになってるな
もう一枚の別pcのGPU方はそういうこと少ないんだが >>129
なんか最近ちょっと重いなーとＷｅｂＣｏｎｔｒｏｌ見てみたらGPUがコケてた。
とりま再起動したら、なんかWindowsの更新がかかってVGAで起動。
画面サイズは変更できたけど、やっぱGPUがコケてる。
んで調べたらWindowsUpdateでGPUドライバを更新して、その更新がコケてるっぽい。
NVIDIAから最新を入れ直してやっと復旧。
GPUがコケてる人いたら疑ってみるべきかと共有します。
Janeといい、勝手に余計な更新するなよ。。。 自分の場合はその環境に割り振れる問題（WU）ないよが続く
一ヶ所だけサーバの割り振る問題合わなくてそこにアクセスすると失敗
次の別のサーバからの問題貰ためにクロールする待ち時間がかなりかかるみたいな症状
計算終わって次の問題もらえるまで失敗し続け
30分止まってたりする FAHの入れ直しとかしてみたら？
Linux板とかでも、バージョンあがって
ｱｯﾌﾟﾃﾞｰﾄかかるときありますよ。 アップデートで上書きじゃなくてアプリ消して
入れ直しでしたっけ
微妙に設定覚えてないかも
特に自IDと長いpass入れるのが… Ubuntuとかは、アプリのｱｯﾌﾟﾃﾞｰﾄでやってましたが
上書きなんじゃないかな。
パスとかは、なんでもいいからテキスト化してファイルで持っておくと便利やで～ >>137-138
F@Hのデータフォルダ配下にconfig.xmlというファイルがありその中にクライアントの設定すべてが保存されている。（Linuxでは/etc/fahclient配下）
このファイルをどこか別の場所にバックアップしておくと何かと便利。 夏頑張ったのでペース落とす
10%多く回したらGPUファンを回転数下げる
あとは秋冬復活組おまいらにまかせたぜ…ぐふっ 涼しくなってきました
夏場まわしてお疲れ様でした
ことしは電気代とにらめっこして
3000番台におきかえるか
4000にするか悩む >>143
40は同じ消費電力でも数倍効率上がって熱も穏やかかもしれん
30はかなり下まで制限しても熱かったな
とはいえ無理に投資するものでもないし… >>147
そうなんすね
40はお買い得って事やね
但しボランティアは忘れない様にしないとですね GPUにもよるけれど参考値でたとえば
周波数が2600mhz前後でウロウロして計算終えるWUと
1600-2760MHzまで乱高下するWUって
あるんだけどなんか違いあるのかな？PLはかなりかけてるので
周波数が上限近くで貼り付いて高いのもおかしい気はする
稀にPCが意図せぬシャットダウン食らってることもあり
これのせいかなぁって気もするんだが GPU性能に対して課題のたんぱく質が小さすぎる場合、PLを下げてもGPUクロックが上限付近で張り付く場合がある。
逆に、課題のたんぱく質が大きいのにPLを下げすぎた場合、クロックが大幅に低下して振れ幅も大きくなり、処理速度も大きく下がる。
F@Hの場合、経験的にGPU本来のTDPの70%程度が良好な場合が多いが、GPUと課題の種類によって適正なPLは異なり一概には言えない。 GPUの場合はPower Limitだね
最大消費電力を指定して性能を制限する機能 回答ありがとう。GPUは、電力の上限内で、演算ユニット(?)の数とその動作クロックを決めるから
タンパク質の規模が小さくて使用する演算ユニット数が少ないときはクロックを上げられ、
逆もまた言えるということと理解しました。 ttps://folding.lar.systems/gpu_ppd/overall_ranks
4090と4080が入れ替わってる珍事？ ベンチマークばかり落とされる
計算させぬなら、やめるぞー ガンにしておくと、ベルリンだかの
自由大学？のベンチばかりやらされる
取り敢えず、プライオリティ高いのにしたら
アルツ落ちてきたけど。
癌は計算ないのかえ？
くっそー、癌の薬に貢献したいけど
なんか闇を感じる もうちょっとわかりやすい情報なり、参加者にもメリットを出さないとみんなやらなくなるよね GPU演算性能跳ね上がっても
何かを成したみたいな劇的な
表舞台には出なさそう
同じ時間マイニングしてた方が目に見える形で
お金が手に入ってたかもとは時々思う 涼しくなったので復帰
来年の4月までじっくりまわすぞ 昨日から急にUbuntu22.04でCudaのdriverがはずれて
しかも計算中っぽくて
昨晩ToolKit使って、localやNetやらｲﾝｽﾄ試したが
入らず＿|￣|○
uninstallして再度入れてもダメ
手こずってる、パイソンまでおかしくなった様で
今夜pythonも直してみる
Ubuntuぶっこわれたかな
めんどいな 涼しくなったんだけど回すと40度くらいの廃熱出るから
温風こもってしまうと徐々に居心地悪くなっていく
エアコンはやや寒いしある意味難しい季節 結局Ubuntu再インストした
キーが壊れて、削除しても追加してもダメ
初期化してもだめ
再インストが一番早かった＿|￣|○ 久々にゲームアマプラで貰ったghost wire Tokyoやるかな
ゲーム中はこっち回せないから効率下がりまくる
デスストランディングもやりたい気がするが貰ってそのまま 夜中の暖房がわりに2コア回してるけど、電気代が心配になってきた… project17118来てるけどbase1000
でなんか挙動変だな
データ送る時アプリがupdatingで暗転状態になる 過疎ってて寂しいコロナで盛り上がって
増えたけどその後むしろ逆に人が減っちゃったな
免疫系の難病とか実績出て欲しいな >>168
ここの書き込みも減ったね。ただ、人が減ったというより、分散してるんじゃかと思う。
詳しくはないが、Tokyoなんちゃら等、いろんなコミュニティもあるようだし。
今は、COVID-19が一段落して、この数年間で得られたものをまとめている段階にあるようだよ。
この間にも研究は活発に続いていて、中心のボウマン先生の名前の入った論文は毎月のように発表されている。
特に、F@H について総括された3月の論文では、この20年間の研究で成し遂げたことが整理されている。
元は英語だけどGoogle翻訳等で日本語で読めるよ。
Vincent A. Voelz, Vijay S. Pande, Gregory R. Bowman
March 21, 2023
Folding@home: Achievements from over 20 years of citizen science herald the exascale era
DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2023.03.028
ここで、創薬に関しての成果は、COVID Moonshotに参加して、数千個もの候補物質をふるい分けして
候補薬を絞り込むのに貢献し、臨床試験に向けて進んでいると書かれている。(薬として承認されるには時間がかかる)
F@Hが成し遂げたことで一番すごいのは、このふるい分けをボランティアのPC上で行うという、
新しい創薬の仕組みを実現したことで、1つの物質あたり数10万円かかる化学実験を省略し、
通常は10年と数千億円かかる薬の開発期間と費用を大幅に縮めたこと。
そのためのソフトウェアを開発して他の研究室や企業で利用できるようにしたことだと思う。
p.s.
本家F@Hのサイトに、ボランティアに向けた解説記事が載っていた。昨年作られたページで、
分子の挙動をどういう風にシミュレーションして宿題として配り、ボランティアのPCで何をしているかを
説明している。これも英語だけどGoogle翻訳でページで翻訳して読めるよ。
さらに深く掘り下げる
https://foldingathome.org/dig-deeper/?lng=en
>> Folding@home シミュレーションがどのように機能するのか、そしてなぜ私たちの方法が
>> 分散コンピューティングから恩恵を受けるのかについて説明します。 covid-19が流行してからFHとboincに参戦してきた口だけど、分子生物学を専門に学んだ訳じゃないからせいぜい「6コア回しても室温上がらねぇwww寒すぎワロスwwww」位しか書き込めない(´･ω･｀)
boincスレは荒らしに襲われてるし
>>169
こんな論文が出てたのか
今晩じっくり読んでみよう 自分もCOVID-19以降、手持ちのPCでBOINCとF@Hに参加したが、今は止めてしまった。
研究の仕方もスピードも上がってきたのに、自分のマシンが古くて計算できないのは寂しいが、
貢献するしかたは他にもあると考え直してる。毎年1万円くらい寄付したり、
>>169 のように、活動の成果をスレ住民に紹介するのも一つで、みんなの参考になればいいかなと。 2chチームで3年前は1千万で100位程度
だったけど今じゃ2億近いもんな
性能跳ね上がり過ぎて変わらぬ環境だと
モチベーション維持大変かもね… 一方で、すごい勢いで抜いている人も居るし、たぶんより新しいハードウェアを導入してるんだと思うけど、
そういう移り変わりがあってこの活動が続いているじゃないかな
数年前にGPUが計算の主体になって久しいが、AIなど新しいシミュレーション手法が開発されれば
また別のハードウェアが台頭するかもしれない >>177
Radeonでも同等程度に引き上がる
プロジェクトとかできんかな？現状CUDAコア
無いとなぁ COVID-19の頃、NVIDIAはFAHを支援してきたことも大きいかもね 一部のGPU課題で0x23という新バージョンのcoreを使うようになっていて、
この新しいコアに移行した課題はまだ1種類のみのようだが、処理速度・PPDは爆上げ
0x22コアで処理していた時に比べて自分のPCでは1.4〜1.5倍のPPDになっている 一部のGPU課題で0x23という新バージョンのcoreを使うようになっていて、
この新しいコアに移行した課題はまだ1種類のみのようだが、処理速度・PPDは爆上げ
0x22コアで処理していた時に比べて自分のPCでは1.4〜1.5倍のPPDになっている >>180
そのコアバージョンに見覚えがあると思って検索したら、8月ころ、ハングするトラブルが報告されていた
それが安定してきたようだね >>182
ハングは新しいWUのせいではないよ
たまたま書き込み近くて誤解招いたのなら申し訳ないが
一度コンセント水没クラッシュのpcなんで当時負荷かかる場合
やや不安定だった
今は組み直しと点検でもう問題ないけど ちゃんとスレッド数を制限するよう設定してるのに
設定無視してCPUの全スレッド使うし、これには使わないGPUを
スロットからRemoveしてるにもかかわらず再起動したりすると
いつの間にかに復活してる
こっちは割けるリソースだけ割いて協力しようとしてるんだが
勝手に全リソース使おうとするなら協力したくないな ああわかるでもなんか続けてるなmediumにして
スレッド数制限してもダメなんか？
基本CPUコア跨いだら全コア使ってる風で表示周波数は上がる
けど有効にしたスレッド分と別途作業やアイドル分しか使ってない気がしたが
（hwinfo読みで） チーム2chは過疎だけど全体順位だと自分付近の人がかなり活発に動いてて
f@h全体の順位で見るようになった
もう寂しくなんて無いんだからねっ 今まで気温が高くて12月になってからようやく復帰したよ ｵﾚも戻ってきますたー
電気代怖くて全部回せん、どうしたもんか・・・。 ｵﾚも戻ってきますたー
電気代怖くて全部回せん、どうしたもんか・・・。 RTX3060なんですが、今までの最大でも100万PPDほどです。
ttps://folding.lar.systems/gpu_ppd/brands/nvidia/folding_profile/ga106_geforce_rtx_3060
ここによると3060の平均は190万PPDほどらしいのですが、最大100万PPDは正常なのでしょうか？ >>190
BEST PPDとWORST PPDの差がかなりあるから、190万ってのはそれなりの期間継続して動かした場合の平均値だと思うよ
たまに動かして100万ならそんな事もあるんじゃないかと
ずっと動かしてて100万なら何か問題がありそう >>191
さっきのサイトでは、PPD5位までLiquid-Phase-SeparationとCovid-19が占めていて、ワースト5位をCancerが占めていました。
今解析しているのはProject 18806なんですが、これがCancerみたいなのでそのせいみたいです。 思い出したのでスレを見に来たわ。
上位５人がすげーことになってる気がするけど、それ以外はみんな休眠しちゃってるなあ。
後で帰宅したら久々に立ち上げて復帰するわ。 WEBじゃなくてアプリの方だけどconfigureのスライドをmidiumとhardでも落ちてくるWU変わる？今までずっとmidiumでほぼ同じようなの数ヶ月回すけど統計にあるような高効率または逆のワーストなんかは見たことないWUも結構あるんだよな >>194
推測だけど変わると思う。下記のページにそれぞれの選択肢の意味がかかれていて、DeepLで翻訳したものを付けるが、
スライダーの位置によって処理能力が変わってくるので、それに見合ったWUが送られるようになるだろうから。
ただしこのスライダーはCPUにとって意味があるけど、GPUには効かない。したがって、フルにするとCPUの余裕が無くなるので、
GPU処理の速度は下がると思う。検証してみて。
ライト
CPU は半分の速度で Folding され、GPU Folding はオフになります。
ミディアム
CPUは4分の3の速度でフォールディングします。GPUフォールディングはオンです。これはデフォルト設定で、ほとんどのユーザーに推奨されます。
フル
CPU はフルスピードでフォールディングします。GPU Folding がオン。これは最も生産的な設定です。ファンの回転が速くなり、より多くの熱が発生する可能性があります。
FOLDING POWER SLIDER
https://foldingathome.org/faqs/fah-v7/v7-introduction/web-control/folding-power-slider/?lng=en 7840uのAPUにも対応したみたいだね
CPUと同じくらいの処理速度な感じ ちょっと試してみます
WUも3ヶ月くらいいつものメンバーみたいな
の繰り返し解いてる気がするかな 振り分けられるWUに変化なしに見える
PLかけてるとかも影響あるかな？ >>198
PLってパワーリミットの意味？ だとしたらあるのでは？
というのも、個々のクライアントマシンの機能や性能に応じたWUが割り当てられるので、そこに変化がなければ
同じ結果になるだろうと
あるいは計算力を提供するボランティアが、注目する病気やプロジェクトを指定していたり (例: COVID-19、がん)
ハードウェアを特別にカスタムしたり、その運用を調整していたら、そういう制約も考慮されるだろうし
FAHは、プロジェクトや研究者が使っているので、彼らは少しでも早く、優れた研究をしたいじゃん
ボランティアのPCは1台1台の性能や信頼性の実績が蓄積されて、評価されて、より研究に好ましいPCには
より高い報酬(ポイント)を与えるようにできている
無償だけどビジネスでもあるわけで、もし特定のプロジェクトを応援したいとか、多くの計算力を提供したい
(高いポイントが欲しい)なら、それなりの戦略を立ててゆかないと難しいかもしれないね
同じ考えの人は世界中にいるから
FAHのポイントシステムの考え方については上の3つに、より高い報酬を得たいなら下の2つあたりを参考にしてみて
https://foldingathome.org/support/faq/points/?lng=en
https://foldingforum.org/viewtopic.php?t=30034
https://foldingforum.org/viewtopic.php?t=37221
https://www.pvladov.com/2017/02/how-to-maximize-folding-at-home-ppd.html
https://www.publish0x.com/terry-kepner/the-what-s-and-why-of-folding-at-home-xrnodkz 今年はカーチャンがボケたのでアルツハイマーがんばろうかな笑
いや～ボケはじめは大変だった 自分もアルツハイマーと癌でやってる
なんとなくアルツハイマーはGPU、癌はCPUが強いイメージ みなさま良いお年をお迎えください
来年もぼちぼち頑張りますので
よろしくお願いします 皆さん、良いお年をお迎え下さい(^_^)ﾉ
不治の病が、このボランティアで
少しでも治ることを願っております 今年は4年前に植えた痩せ細って枯れかけの蝋梅が徐々に大きくなってて
さっき確認したら3個ほど花が咲いてた
観察してなかったのですごく嬉しい花芽も続々できてたので
もしかしたらしばらく咲き続けるかも
買った時は押したらパキッと折れそうな乾燥枯れ枝に花が1個付いてたのが不憫で
引き取るように買ったんだよなぁ 日記読んでくれるなんて優しいね
蝋梅って雰囲気柔らかくて可愛いんだよね ついにRTX4090買ってしまった
でもPLかけまくって使うので特に高効率ではない
どこに向かってるのかわからない投資したな 高効率ではないというけれど電力あたりのポイント数の向上は見られない? いいね～
最上位チップに手を出したことのない人生だった 過去形にすることないでしょ
なにがしかチャンスが転がり込んで買えるかもわからんよ 4090PL50（220W推移）でも1500-1900万/day
って感じの表示が出る
数時間しか回さんけど PL40だと一気に1200-1400万/dayって落ち込む
180Wはかなり魅力的だけど… 自分は高スペックのPC余裕ないから高スペックで参加している方々を応援しながら低スペのノートPCでしか参加出来ないのが残念なんよな... 他スレでも貼ってしまったが組んだPC上げときます
ttps://i.imgur.com/PnTRuBx.jpeg
散歩コースで咲いてた蝋梅
ttps://i.imgur.com/TrXcSc3.jpeg
生暖かく見守ってください… 強風&大雨降ったら花全部散って蕾ももげて落ちてたショックだわ
PL50%で運用始めた電源ファンが唸ってるかも電気代も1割り増しか… オープンフレームいいね
うちは静音ケースに詰めて定期清掃
粉埃がすごいんだよな いや～今日は庭にちょうちょが飛んじゃったりして
冬どこいった 日当たり良かったのかこの時間で室温が23度…
そこに排熱60度（リアファン付近は40度弱？）
まあ寒いよりは良いんだけどさ F@H止めて1年になる。研究のためとはいえ、納期を切られるのはつらかったな。 CPU多コアの時間制限シビアさと他業務の合間にやる場合のシステム不安定さよ…
諦めてGPUだけPLかけて動かしてる GPU売って親父の治療費に充てるかな
ボランティアよりもボランティアか？ WUによってGPU音結構変わるね
今までジーコジーコ言ってたのに
最近は無音のも増えたみたいだ
まあおま環境なんで共有できるわけじゃないし
ゲームなんかじゃ鳴かないんだけどなぁ 
