少しまとめるとエレンの目的は
①ミカサとアルミンは４なせたくない（それ以外は自分を含め４の覚悟をしている）
②巨人を駆逐する（この世から巨人をなくしたい）
③パラディ島をできるだけ守れる状況にもっていきたい（地ならし発動）
で、ミカサのある行動で、エレンの保有してる進撃の巨人の能力（未來視)が途絶えることを知り
①～③の条件を妥協のいく範囲でいじくり実行したのではないかな？