とりあえず、俺はこれ(↓)を入れてる。ちなみに、環境はPC-98Windows95。
Neccd.sys          ;NECの汎用CD-ROMドライバ
Mscdex.exe          ;なんか、CDドライバ読み込むのに必要。
Extract.exe         ;CD-ROM内のCabファイル解凍
Command.exe         ;MS-DOSの基本コマンドを使う
Fdisk.exe          ;パーティーションいじる
Format.exe          ;フォーマット・FDとかHDのフォーマットに使う。
Xcopy.exe          ;まとめてコピるのに使う
Dossetup.bin
Winsetup.bin
Oemsetup.bin        ;この3ファイルはDOSからWin95をインストールするときに必要
Setup.exe          ;Windows95のセットアップ
Scandisk.exe         ;スキャンディスク
Chkdsk.exe          ;これも便利

これぐらいかな。もう少しあるかもしれないけど覚えてるのはこれだけ

あと、Windowsの起動ディスクは何かと便利だからインストールした直後、またはインストールの途中に
作っておくといい気分。