経験者枠の採用で、休職期間のせいで職歴の期間を満たしてないとかなら普通に内定取り消しは有り得そう。
だた、職歴関係なしの枠で、初任給決定する段階での発覚ならなんとかなると思う。人事からなんと思われるかは知らんが。