・エーテルに捕まったコスモッグが自力でワープしてククイ博士の家に紛れ込む
・同じ頃に引っ越してきた主人公がたまたま外で野生のポケモンに襲われたコスモッグと遭遇し助ける
・博士から事情を聞き、御三家を貰って島巡りをしながらコスモッグが何処から来たのか調べ始める
・スカル団の用心棒をしているグラジオに遭遇し、コスモッグとエーテル財団が関わってる事を知る
・エーテル財団とウルトラビーストのアローラを巻き込んだいざこざを解決するために主人公とポケモンたちが立ち上がる


……うん、リーリエ居なくても物語成り立つじゃん
本当に何で居たのか分からないわ