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赤緑～ＢＷまでの悪の組織

ロケット団
ポケモンを奪い世界征服を企む組織
資金源はタマムシシティにあるロケットゲームコーナー
１００％捕獲できるマスターボールを独占するためヤマブキシティとシルフカンパニーを占拠する
ボスはサカキで表向きはトキワシティのジムリーダーをしているが裏ではロケット団のボスをしている

マグマ団アクア団
マグマ団は陸を増やすため活動してどこかに眠っているグラードンを探している
アクア団は海を増やすため活動してどこかに眠っているカイオーガを探している
球を使い眠りから覚ますことに成功するが制御できず自然の驚異に呆然とする
ルビーサファイアでは主人公が鎮めるがエメラルドではレックウザが鎮める
その後は反省をして奪った球を元の場所に返す

ギンガ団
今の世界に落胆し新世界創造を目指しディアルガパルキアを探し求める
しかしそれはアカギが新世界独占するために団員を利用していたことだった
ダイヤモンドパールでは主人公に邪魔されるが
プラチナではギラティナが創ったやぶれたせかいに行き満足する

プラチナ団
トレーナーからポケモンを解放するために活動しているが
しかしそれはゲーチスが解放されたポケモンを独占するために団員を利用していたことだった