マークアップって必要かな。目次と内部リンクができればあとは要らない気がするけど。
活発なのならPukiWiki系のPukiWiki Advance。アップデート作業が嬉しいというのはよくわからないけど。
サービスならhackpad（有料で非公開Wikiも作れる）