どこで聞けばいいのか分からなかったのでこちらで質問させていただきます。

Surface Pro3でDrawboard PDFというソフトを使っています。
1つのファイルにページ追加を繰り返してノート代わりに使っていたのですが、ずっと開きっぱなしにしていたらいつの間にかファイルサイズが3GB近くなっていました。
ずっと使っているといっても、ページ数は50ページもないので、さすがに大きすぎるので、開きっぱなしが悪いのかと思いSave & Closeをしたのですが変わり有りませんでした。
しかし、Save As (Optimized)というのをしたところ、150MB程度にまでファイルサイズが縮小されました。
書き込み情報が埋め込まれた（？）ことで縮小されたのかとも思いましたが、書き込んだ文字の移動や削除など編集も変わらず可能でした。
およそ3GBにもなる情報は一体なんだったのでしょうか？
通常のSave & Closeだと削除されないとなると、Save As (Optimized)で3GB分の情報を削除したことで出来なくなった作業があるのではないかと思うのですが…。

一体何の情報が削除されて、何が出来なくなったのでしょうか？