ミドルハイ以上のグラボとCPU使う場合のPCケースは効率よくCPUとグラボから熱取り除く箱になってる
無印で発熱しないCPUにミドル以下のグラボなら全入りしてもいいと思う

Takeoneは10年ぐらい前のSSD＋HDD主流だった時と作り同じだからなんとなくみんなHDDつけちゃうんだろうけど
HDD発熱一応するし、システムドライブじゃなくてもHDD故障した時にOS巻き込んだりする
読み書きでもはや差がでないから5インチベイでHDD安く沢山管理したいとかでもないと外付けを薦める

光学ドライブも内臓でもつ理由がほぼない、内臓のベイはほぼSATA接続のSSDの増設用で使われてる