容量が違うどころか、メーカーが違っても正常に動いてます
Kingstonの1GBとIO DATAの2GB、計3GB (XPでも7でも動作)

DDR2は相性問題が結構きびしいみたいですね

2枚組みで買っても、1枚は故障っぽくて×というのもあったり
故障ではないのに2枚とも相性が全くダメというのもあったり・・・

DDR2のメモリを買うのなら、少々高値でも相性保障ありのところで買うとか
OKだったという情報をよく調べてからのほうがいいみたい