Folding@Homeで難病解明 Part5【FAH】
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これは、タンパク質がどのように自力で組みあがっていくか(folding)を
シミュレートし解明する分散コンピューティングプロジェクトです。
アルツハイマー、狂牛病、パーキンソン病などはタンパク質の異常なfoldingが
原因と考えられており、foldingを解明することはこれらの疾患の解明につながります。
みなさんのコンピューターの余力を使って、タンパク質のfoldingという
複雑な問題を解明しましょう。
前スレ
Folding@HomeでBSE解明 Part4【FAH】
http://pc11.2ch.net/test/read.cgi/pc/1167199477/
参加方法
http://folding.stanford.edu/English/download で
ダウンロードしたら早速開始して名前を登録、
チーム番号に162と入れればチーム2chに入れます。
あとは勝手にやってくれます。
名前を決めるときは、上記ダウンロードサイトで既に使われてないか確認しましょう。
(日本語はバケる可能性あり)
OSは、Windows、Mac(OS Xのみ)、Linuxに対応。
追加情報は>>2-10あたり ☆周辺ツール
Foldmonitor用スキン
Spectre's Foldmonitor/Genomemonitor Graphics and Skins
http://thelowroad.tripod.com/
UD Monitor(Win)
http://distributed.org.ru/?udmon
Electron Microscope(Win)
http://home.comcast.net/~wxdude1/emsite/index.html
fahmon
http://fahmon.silent-blade.org/
☆関連サイト
Folding@Home Wiki (English)
http://fahwiki.net/ PS3での参加方法
■当スレッドのチーム
チーム番号:162
チーム名:Team 2ch
http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&teamnum=162
■チームの参加方法
PS3からFolding@homeを起動し、チーム番号162をPS3に入力すればOK。ユーザ名は何でも良い。
確認としては、「オプション(△)」→「関連サイト」→「チーム処理統計量」と開き、
「Team 2ch」(上記URLのページ)が表示されればちゃんと参加できている。
■Folding@homeについて
http://folding.stanford.edu/
http://folding.stanford.edu/Japanese/Main
Folding@home for PLAYSTATION3 http://www.scei.co.jp/folding/jp/index.html
■FAQ
FAQ
CPU版とGPU版の同時起動可能
SMP版とGPU版の同時起動も可能
GPU2版はRadeon HD シリーズ以降、GeForce 8xxx シリーズ以降対応
※CUDAが使用できるnVIDIAGPU製品一覧 http://www.nvidia.co.jp/object/cuda_learn_products_jp.html ●WindowsSMP版について
Q : SMP版って何?
A : デュアルコア・クアッドコア等、複数スレッドを扱えるCPUで実行することにより、
CPU版よりも早く計算する事が出来るクライアントソフトの事。
Windows SMPベータ版
【インストール手順】
1. MS .NET framework 2.0 をMSのサイトからダウンロードしてインストール。
2. F@H Windows SMP Client をダウンロードして実行。(自己解凍)
→複数のF@Hを使う場合は、別フォルダに入れる。
3. 解凍後にできる、install.bat を実行。
→Windowsの管理者アカウント名とパスワードを聞いてくるので入力する。
【実行方法】
4. 他のClient版と同様 fah.exeを実行。
→初回実行時は色々聞いてくるので入力する。(Team 2chのteam番号は162です)
【補足メモ】
・設定変更をする場合は fah.exe -configonly
・設定画面で値を入力せず初期値のままEnterを押すと、エラーで落ちる場合がある。
初期値を入力してEnterを押せば落ちない。
・client.cfg をメモ帳等で編集してもよい。
・fahを複数インストールしている場合、machineidは他とダブらない数字にする。
・βにつき自己責任で! ●Console版 初期設定について
【Console版 初期設定】…初回実行時に色々聞いてきます。Console版もSMP版もほぼ共通です。
User name [default]? → ユーザ名を入れてください。日本語は使ってはいけません。
他の人とダブってないか調べるには ダウンロードページで名前を入力してsearch をクリック。
http://folding.stanford.edu/English/download
Team Number [0]? → チーム番号を入力します。Team 2ch なら 162 を入力してください。
Launch automatically at machine statup, installing this as a service (yes/no) [no]?
→ 通常は No を入力します。(SMP版やGPU版はserviceモードを使えないので No 必須)
→ Windows console版 ver5.04 等で Serviceモードで常駐させたい場合は Yes を入力します。
Ask before fetching/sending work (no/yes) [no]? → 常時接続なら No がお勧め。
→Yesの場合は WU(=宿題)取得時と提出時に確認メッセージが表示されます。
Use Internet Explorer Settings (no/yes) [no]
→ IEのProxyの設定をF@Hで使う場合は、Yes
Proxyを使わない場合や、手動でProxyを設定する場合は No
分からない場合はとりあえず Yes
Allow receipt of work assignments and return of work results greater than 5MB in size (such work units may have large memory demands (no/yes) [no]?
→ Yesにすると大きめの宿題(Large WU)がやってきます。Large WUはボーナスポイントが付くので Yesをお勧め。
SMP版の宿題は全てLarge WUなので、Yes必須。(NoにしてもLarge WUが来る?)
Change advanced options (yes/no) [no]?
→ 通常は Noで良い。
CPU使用率(CPU usage requested)や中間ファイル保存間隔(Interval between checkpoints)を変更する場合や
Machine IDを変更する場合(=1台のPCで複数のF@Hを動かす場合)は Yesにする。
詳細は以下のwiki(英語)参照
http://fahwiki.net/index.php/How_do_I_reconfigure_the_console_client_options%3F#Configuration_Options ●Windows Vistaについて
【VistaにおけるSMP版の使用について】
・>>6の1は、Vistaに標準で.NET framework 3.0が入っているため、作業する必要なし。
・>>6の3を実行する際、UAC(ユーザーアカウント制御)を無効にすること。
UACを無効にするには、スタート → コントロールパネル → ユーザーアカウントと家族のための安全設定 →
ユーザーアカウント → ユーザーアカウント制御の有効化または無効化 →
ユーザーアカウント制御(UAC)を使ってコンピュータの保護に役立てる(…のチェックを外してOKをクリック&再起動)
※ただし、UACを無効にすると、一部のソフトで動作に支障をきたす場合がある(例:ギコナビ)。
■ツール
・[FahMon] F@H用モニタリングツール
http://fahmon.net/
完了予測や1日あたりのポイントを計算してくれます。
クライアントは手動で追加する必要があります。
追加するには
1. 左側の白い部分で右クリック
2. 「Add a new client」を選択。
3. Name欄は適当に入力してください。
複数台使ってる人はコンピュータ名を入れると区別しやすいと思います。後から変更可能。
4. Location欄は F@Hをインストールしたフォルダを指定してください。右側のボタンを押すとフォルダの指定画面が出ます。
FahMonオンラインヘルプ(英語)
http://fahmon.silent-blade.org/index.php?n=Main.Help ■ このスレッドは過去ログ倉庫に格納されています