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一番の違いは販売数。
メーカーの場合はマニュアル、筐体、CMなど専用品が多く、
容易にモデルチェンジできないから、一定期間パーツの確保が必須。
また、サポート体制の整備にも金がかかる。
ショップはその時点で安価に入手できるパーツで、細かくモデルチェンジが可能。
品切れをおそれる必要がないので、在庫を削れる。

現在のPCの製品寿命だと、ショップの方が最適化しやすいんだよ。