>>31の問題はかなり改善されるんだが、別の問題が発生する
・二軍だけとはいえプロとして扱うわけだから、独立の選手とプロ契約しなければいけない
・独立リーグは事実上解散となり、NPB二軍球団として独立採算制で運営していかなければならない
・現在のNPB二軍リーグのシステムでは独立採算制チームの運営は厳しい(既存12球団が独立側に合わせる必要あり)
・独立リーグが解散消滅すると、結果的にプロを目指す人たちの受け皿が縮小する

でも不可能というわけではないと思う
フェニックス・リーグでの四国アイランドリーグの選抜チームのように、
独立リーグ代表選抜チームを一球団作り、そこにちゃんとした本拠地と親会社を付ける
こんな感じでスタートしてみたらいいんじゃなかろうか