ダメージメーターはその考えで合ってます。

マイナスは、全ダメージ量が２，０００，０００，０００を少し超えた辺りから
マイナスになり始めます。
おそらく不具合か、こんなに大きくなると初期は想定してなかったか、です。
ある程度ダメが出るようになると計測しづらくなるので
硬い敵の討伐速度…試練の迷宮のクリアタイムやフィールドの殲滅速度
などを参考にし始めます。火力確認はソロでレイドをやるという方もいるとか。
ダメージ限界に達し始めればヒット数から計算しやすくなるので
おおよそのDPSは計算で出しやすくなると思います。