取得単価毎に取引することは出来ませんか？

A証券で3000円100株、B証券で2000円100株持っていましたが、
B→A証券に移管すると2500円200株になってしまいました
100株だけを長期保有し、残りの100株は現在値3200円で売却したいのですが、
3000円で取得した100株だけを売ることは出来ますか？(税金対策のため)