手数料取られてるって人がいるから、おそらくJCBカードへの出金依頼はJCB経由での返金ではなく、アイフォからの直接入金になってるんじゃないかな?

以下、全部俺の憶測だけど

JCBとは関係断裂してるため、カードの売り上げキャンセルができず、アイフォが客に直接銀行振り込みで返金対応すると
アイフォがJCBに引かれてる手数料5%分だけ損することになる。
そのためそれも客が負担させられ、手数料5%プラス銀行振り込み手数料2000円が引かれた分が入金される。
上の方で手数料引かれてるって人がいたけど、たぶんこれじゃないかな。
振込元がJCBではなくアイフォになったら間違いないんだけど。

そうだとするとこまめに出金すればするほど銀行振り込み手数料分も損することになる。