教養というか、社会人として一般的な知識を教えて下さい。

飲み屋さんとかで正式な領収書をもらう人というのは、自営業などの、サラリーマンではない人であって、
それは、「仕事で必要な飲食代です。これだけの額を使いました」という証明のためにもらっている
場合が多い、というのはなんとなく知っています。
しかし一方で、今どきはいちいち税務署に行かずにネット上で確定申告（収入や経費や実質的な利益の報告）を
するらしい、というのも聞いたことがあります。

では、ああいう領収書っていつどうやって使っているのでしょうか？
ネット申告のときにスキャンしておいたものをアップロードしたりするんでしょうか？
それとも、そういう領収書類はけっきょく、ネット申告後に税務署に行って直に提出してるんでしょうか？

税理士をやとったりする大金持ちではなく、「フリーでイラスト描いてます」って感じのバイトレベルの人を前提に教えて下さい。