>上司の立場上認められない様な事を運用上やらなきゃいけないなんて普通の職場ではあり得ないし、

普通の職場だとそんなことばかりだよなあ
うちの会社だと、9時以降は遅刻になるけど、9時半とかに来るやつも多めみてる
でも会社の人事部門の査察が入ったら、完全アウト

上司が取る責任なんて、こんなとき人事に注意される程度だわ
上司が擁護しようと社則は9時だからな