九大工学部は全員が一般入試での入学者となるために、AO枠を多くとって一般入試の倍率を上げて、見かけの偏差値を稼いでいる理学部、農学部、芸術工学部よりも、偏差値が出にくい(偏差値は一般入試の倍率が込みされるため)ことが原因か？

駿台全国模試で
工学部は偏差値53
理学部は偏差値55