まず難易度が頻出1000>スクランブル
網羅度はスクランブル>>頻出1000(頻出1000は文法語法のみだが、スクランブルはそれに加えてアクセント・発音・イディオム・語彙・会話表現があるため)

理想としてはスクランブル→頻出1000だけど、頻出1000は優先度低い。志望大学に難しい文法語法問題・正誤問題・整序英作文が頻出ならやるべきだが