素朴な疑問なのですが、何故政令市や大きな自治体が人気あるのでしょうか。

公務員の場合、(よほどの小さな村などを除いて)自治体が潰れることはないし、
給与水準も大きな自治体と小さな自治体で特に差異もありません。