何でも何も、和宮は朝廷から「京に戻れ」とずっと言われてたからでしょ?
明治天皇には数少ない身内だし(叔母宮は桂宮と和宮だけのような)

徳川家を守ると江戸に留まってたのは、内親王かつ天皇の叔母である自分がいれば官軍が攻めづらいとわかってた
実際、有栖川宮達は和宮がいるから江戸を攻めあぐねてたし、朝廷も「家茂死んだんだから帰ってこい」と急かしてた

明治になっても、しばらくは慶喜は逆賊扱いされてたし、徳川家当主を養育する天璋院と、天皇に近い血筋の皇族の和宮が同居は無理だよ