なぜって花が時計にそっくりでしょ。

南米原産で、イエズス会がその花をキリストの受難を見立ててflos passionis（パッションフラワー）と名付けた
日本には江戸時代に渡来とあるから
当時禁教だったキリスト教由来の名前は普及せず、見た目からトケイソウと名付けたんじゃないの。
機械時計はキリスト教伝来と同時に日本に伝わり、江戸時代には和時計が作られていたし。

ちなみにpassionは「受難」の方の意味の方が先。