or2の勇者の能力の弄り方、自己解決しました。
BOOT.BINのデータを変更して、その上でEBOOT.BIN(SYSDIR内の方)に上書きするPSP特有のやり方でないと駄目だった様子。
他のソフトの改造を調べてたら見つかった物なので理屈はいまいち分かってませんが。