>>140
メッシュを一回統合してYAVNEでマージをする
マージしたあとばらしてオブジェクトデータにあるカスタムプロパティーズの設定をもとに戻す

手打ちでカスタムプロパティーズを打ち込んでくのはめんどくさいから
統合前にメッシュ複製しておいてあとからこのスクリプト使ってカスタムプロパティーズコピーしてるわ
https://blenderartists.org/t/addon-copy-custom-properties/591562