一応NDSも動作したけどN64とGBAが、うまく動作させられない。
NDSは「Dragon Quest IX」で試した。
Injectiineの使い方だけど、ショートカットをダブルクリックしただけだよ。
手順としては以下のように実行した。

1. Injectiineのルートフォルダーに　Filesフォルダーを作る。
　(Toolsフォルダーと同じレベル)
2. 「bootTvTex.png」「iconTex.png」と ROMを　Filesフォルダーに突っ込む。
3.Injectiineショートカットをダブルクリックする。
4.コンソール画面が開き種別が表示されるので選ぶ。
(SNESの場合は ROM UTILが起動するのでROMを開きヘッダーがあれば Removeする)
5. Baseとする VCを選ぶ。
6. Title Keyを入力する。
7. WiiU Common Keyを入力する。
8. Game名の表示行数を選ぶ。
9. Game名を入力する。
10. product codeを入力する。
11. Title IDをマニュアルで入力するか回答する。俺はマニュアル入力としたので y
12. Title IDを入力する。（上記でnならたぶん入力がない）
13. createするか聞かれるので yを入力。
14. NUSPackerでpackするか聞かれるので yを入力。
15. Outputを SDに格納して WiiUにInstallする。