俺はミニスーファミの遅延に萎えて
ノートPCにデュアルブートで入れているLinux(Ubuntu)で
RetroArch使ってるけど

その場合のRetroArchの遅延を軽減する設定は
Setting-Videoの中で
V-Sync on
V-Sync swap interval 1
max swap chain 1
hard sync on
hard sync frames 0
threaded video off
frame delay 9 (この数字を大きくするとそれだけ遅延が少なくなるが
処理落ちしやすくもなるので動作確認しつつ処理落ちしないぎりぎりの大きさで)

あとAudioでは
Audio Latencyの数字を下げるとその分映像と音声のズレが小さくなるが
その分音割れしやすくなる
(ちなみにミニスーファミ内蔵のエミュは50msのLatencyがあるらしい)

俺が使っているのはLinuxとはいえx86-64のPCだから参考になるかは怪しいが
俺はこの設定でミニスーファミより遅延の少ない環境ができた