公式見てきたけど
https://community.citra-emu.org/t/where-is-the-cheats-tab/1600/16

Citraはメモリのエミュレートが不完全で、チートコードが正常動作しないゲームも多く
それらにいちいち対応してると作業量が膨大だから、
安定動作するようになるまで機能自体を削除しました
要するにチート機能はもう戻ってこない

みたいな事書いてる人が居たよ
実際プロセスメモリエディタで直接弄ろうとしても
普通に数値検索して変更できるものと、
アドレスが変わりまくりでまるっきりできないのとあったけど
ASLR切っても駄目だしなんでだと思ってたから納得の理由