snes9xは確か2005がVitaの性能的に一番バランス良かったはず
2010はバージョン上がって再限度は良いはずだがVitaには重すぎ
2002は逆に軽いけどゲームによっては再現度に問題あり
2005PlusのPlus部分は重くなってるだけでメリット無い
という評価をGBATemp見たことある

基本2005で、それで重いのだけを2002でやるのがいいらしい
あとはClose to insanityとか最適化したビルドもあるから
うまくいかなかったら探してみるといい