前に書いたんだけど、自分のやり方だと異常に面倒くさいんでわからないと思うのでやめます。
それの代わりと言っては何ですが最近のpcsx2にはデバッグモードにメモリブレークポイントが付いてるらしくて
そっちのほうが便利です。094では不可能だったリコンパイラモードでステップ実行もできる。
下記からDLしてください。

v1.2.1-563-gf7192b8
http://buildbot.orphis.net/pcsx2/