画面の右端にボスの体力ゲージがあるっしょ
そこをよく見ると所々区切られてる部分（横線）があるはずなので、そこまで減らせばボスが形態変化するのですよ
形態毎に敵の攻撃は決まっているので、どの形態でボスがどんな攻撃をしかけてくるのかを覚えるのが重要かな
んで、がむしゃらに避けるんじゃなくってその攻撃に対する対処法を予め決めておくのが更に重要

毎回出来るだけ同じ避け方をする、避けられそうにないキツい攻撃にはボムを使う（追いつめられてから使うより予め使うと決めておくのがベター）、
キツい形態の前に刀を貯めておけるのであれば刀を投げて弾を消すと同時にボスにダメージを与える
・・・こんな感じで毎回出来るだけ同じ行動をとるようにするのが攻略の基本かな

闇雲に撃って避けて・・・ってプレイも楽しいけど、真エンディングを見るのはそれではちと厳しいかもしれない
最初は自分で対処法を考えるのは難しいはずなので、他人のリプレイや動画を参考にするといいよ
ただし上手すぎるプレイは見ても真似出来ないし却って参考にならないから、ギリギリクリアしてる人のプレイの方がいいかも

やたら長い割にあんまり参考にならんアドバイスですまんが、頑張ってくれ！