それ検証した本人だけど、サヨナラ判定は出産時馬齢でFA。
爆発力判定もすべて出産時。配合時に零細→出産時零細から外れる、みたいなパターンでも影響ある。

ただ、爆発力については、爆発力をあげれば確実にSPが上がるわけではない。母馬ごとにその年の出産SPの範囲が決まっていて、その範囲で変動するようなので、爆発力あげたせいでSPが下がったりすることもある。
爆発力をいじって複数パターン試していると「いいのを産む可能性がある母馬」が年ごと決まってるので、その範囲を決めるような隠しパラメータが何かあるんだよな。

あと、SP因子小活性は爆発力+3、大活性は+6。これも確実。