あれは普通にそれぞれ相手に対して心の隅で抱えてる負い目を見たんじゃないの
レックスがニアの好意に気付いてるのは戦闘後会話で分かるし

自分がホムラに好意を向けることでニア嫉妬しているのではないか、
それによってニアとの関係が壊れてしまうのを恐れていたんじゃなかろうか