原作の夜間飛行はあくまで
「薬の生成とかに使われる超珍しい花で、辞典にはものすげー長い名前で載ってる
 あんまり珍しいので魔女達が世界中を探し回ったという伝説がある」
ってアイテムでしかない
魔法世界での体験は最終的に夢や幻のようにメアリの記憶から消えていく

元々こんな設定と展開の作品にあんなバックボーン足して、大筋の展開はそのままなんだから
矛盾まみれになるのは当たり前
この改変に関して米林はなにも考えてないというのは言い切れる