理由3つ考えた。
@仮に改変後「有希」がキョンを拒絶することがあれば、キョンを「プログラム」へスムーズに導くことが困難になる。
従って、改変後「有希」に、キョンに対する印象が好ましいものとなるきっかけとしての記憶を、植え付けておく必要があったから。

A記憶を残すことで、改変後「有希」がキョンに対して好印象を抱き、入部届を渡すであろうと予測したから。
(キョンと二人で文芸部として学生生活を過ごしたかったから。)

Bその記憶が改変前「長門」にとって大切な記憶だったから。

「長門」に欲や感情を見出したい立場としては、AやBを積極的に唱えたい。