期首期末の在庫で管理する方法は必須じゃないよ
税務署の担当者がたまたまそういう人にあたった人がやらされてるだけ

税務署からすると金の出入りが明確に把握できればいいので
印刷代やその他経費を支払った日付けと価格
イベントや書店での日付と売上
これらを金銭出納長とかに記載してレシート類保存しとけばいいだけ
お伺いがあったら在庫見せれば何の問題もない