Folding@Homeで難病解明 Part8【FAH】
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これは、タンパク質がどのように自力で組みあがっていくか(folding)を
シミュレートし解明する分散コンピューティングプロジェクトです。
アルツハイマー、がん、狂牛病、パーキンソン病などはタンパク質の異常なfoldingが
原因と考えられており、foldingを解明することはこれらの疾患の解明につながります。
みなさんのコンピューターの余力を使って、タンパク質のfoldingという
複雑な問題を解明しましょう。
現在、新型コロナウイルスに対抗するための解析を重点的に行っています。
前スレ
Folding@Homeで難病解明 Part6【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1585743584/
参加方法
ダウンロード＆インストール
http://folding.stanford.edu/English/download
名前とEmailアドレスを登録してPasskeyを発行してもらう
https://apps.foldingathome.org/getpasskey
開始して名前・チーム番号・Passkeyを登録
チーム番号に162と入れればチーム2chに入れます。
名前を決めるときは、上記ダウンロードサイトで既に使われてないか確認しましょう。
（日本語はバケる可能性あり）
■当スレッドのチーム
チーム番号：162
チーム名：Team 2ch
http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&;teamnum=162
OSは、Windows、Mac（OS Xのみ）、Linuxに対応。
追加情報は>>2-6あたり ■FAQ
FAQ
CPU版とGPU版の同時起動可能
SMP版とGPU版の同時起動も可能
GPU2版はRadeon HD シリーズ以降、GeForce 8ｘｘｘ シリーズ以降対応
※CUDAが使用できるnVIDIAGPU製品一覧 http://www.nvidia.co.jp/object/cuda_learn_products_jp.html
●WindowsSMP版について
Q : SMP版って何？
A : デュアルコア・クアッドコア等、複数スレッドを扱えるCPUで実行することにより、
CPU版よりも早く計算する事が出来るクライアントソフトの事。
Windows SMPベータ版
【インストール手順】
1. MS .NET framework 2.0 をMSのサイトからダウンロードしてインストール。
2. F@H Windows SMP Client をダウンロードして実行。(自己解凍)
→複数のF@Hを使う場合は、別フォルダに入れる。
3. 解凍後にできる、install.bat を実行。
→Windowsの管理者アカウント名とパスワードを聞いてくるので入力する。
【実行方法】
4. 他のClient版と同様 fah.exeを実行。
→初回実行時は色々聞いてくるので入力する。(Team 2chのteam番号は162です)
【補足メモ】
・設定変更をする場合は fah.exe -configonly
・設定画面で値を入力せず初期値のままEnterを押すと、エラーで落ちる場合がある。
初期値を入力してEnterを押せば落ちない。
・client.cfg をメモ帳等で編集してもよい。
・fahを複数インストールしている場合、machineidは他とダブらない数字にする。
・βにつき自己責任で！ ●Console版 初期設定について
【Console版 初期設定】…初回実行時に色々聞いてきます。
User name [default]? → ユーザ名を入れてください。日本語は使ってはいけません。
他の人とダブってないか調べるには ダウンロードページで名前を入力してsearch をクリック。
https://foldingathome.org/start-folding/
Team Number [0]? → チーム番号を入力します。Team 2ch なら 162 を入力してください。
Launch automatically at machine statup, installing this as a service (yes/no) [no]?
→ 通常は No を入力します。
→ Windows console版 ver5.04 等で Serviceモードで常駐させたい場合は Yes を入力します。
Ask before fetching/sending work (no/yes) [no]? → 常時接続なら No がお勧め。
→Yesの場合は WU(=宿題)取得時と提出時に確認メッセージが表示されます。
Use Internet Explorer Settings (no/yes) [no]
→ IEのProxyの設定をF@Hで使う場合は、Yes
Proxyを使わない場合や、手動でProxyを設定する場合は No
分からない場合はとりあえず Yes
Allow receipt of work assignments and return of work results greater than 5MB in size (such work units may have large memory
demands (no/yes) [no]?
→ Yesにすると大きめの宿題(Large WU)がやってきます。
Large WUはボーナスポイントが付くがノートなどGPUが死んでるやつには到底できない宿題が降ってくるので一般人はNoを強く推奨
Change advanced options (yes/no) [no]?
→ 通常は Noで良い。
CPU使用率(CPU usage requested)や中間ファイル保存間隔(Interval between checkpoints)を変更する場合や
Machine IDを変更する場合(=1台のPCで複数のF@Hを動かす場合)は Yesにする。 ●Windows Vistaについて
【VistaにおけるSMP版の使用について】
・>>6の1は、Vistaに標準で.NET framework 3.0が入っているため、作業する必要なし。
・>>6の3を実行する際、UAC（ユーザーアカウント制御）を無効にすること。
UACを無効にするには、スタート → コントロールパネル → ユーザーアカウントと家族のための安全設定 →
ユーザーアカウント → ユーザーアカウント制御の有効化または無効化 →
ユーザーアカウント制御（UAC）を使ってコンピュータの保護に役立てる（…のチェックを外してOKをクリック＆再起動）
※ただし、UACを無効にすると、一部のソフトで動作に支障をきたす場合がある（例：ギコナビ）。
■ツール
・[FahMon] F@H用モニタリングツール
http://fahmon.net/
完了予測や1日あたりのポイントを計算してくれます。
クライアントは手動で追加する必要があります。
追加するには
1. 左側の白い部分で右クリック
2. 「Add a new client」を選択。
3. Name欄は適当に入力してください。
複数台使ってる人はコンピュータ名を入れると区別しやすいと思います。後から変更可能。
4. Location欄は F@Hをインストールしたフォルダを指定してください。右側のボタンを押すとフォルダの指定画面が出ます。
FahMonオンラインヘルプ(英語)
http://fahmon.silent-blade.org/index.php?n=Main.Help スマン。前スレ>>950踏んでた。
ログ気がつかなくて申し訳ない（'・ω・'）
すまぬ。。。すまぬ。。。 >>13
テンプレ修正案の中でいきなり出てきた話なのでドンマイ
前スレのテンプレには記載されてなかったし
こっちも丸投げしてしまったので
快く引き受けてくれた>>1に感謝ですわ >>14
>>1と心優しき住民に感謝！( ゜ω゜)ゝ コロナウイルス解析がどれぐらい進んだのかとか、どう利用されたのか、
進捗がわからないし、達成感がないし、結果社会がよくなったっていうのがわからない
計算能力がすごいというより、どう社会の役になったのかがわからないと
電気代かけてまで・・・ってなっちゃうからな 以下の中のSat Mar 21, 2020 3:25 pmのレスの中に、
https://foldingforum.org/viewtopic.php?f=106&;t=32628
以下のリンクがあり、これをオリジナルのFAHViewer.exeと入れ換えたら
viewerがデモでなく計算中のタンパク質を表示するようになりました。既出？
http://meertronix.com/FAHViewer.exe
ただ、複数スロット利用してる場合、最後のスロット（自分の場合、2スロット中の2個目）のタンパク質しか表示されません。 >>16
何度も書いてるけど参加者が分かる実績はスコア、電気代、マシンの劣化
まったりと半力で長くダラダラやるのがいいよ この手の解析はダメ元で大量のデータを１つ１つ潰していくような
効率の良くない作業だから中々成果が出にくいし進捗も見えづらいんだよな
貢献してるのは間違いないんだけど具体的に見えてはこないから
そこは割り切らないと後々しんどいと思う 電気代を研究費として寄付してると割り切ってしまえばいいんだろうな
というより
参加者同士がランキングを競い合ってるという
ソーシャルゲーム的な楽しみ方するのが無難なのかな
電気代とかマシンの劣化は課金要素みたいな >>17
もしかしたら既出かもしれんがここしばらくは新参者も多いし有用な情報と思う
というか初めて知ったわ。試してみる。ありがとう >>1
お疲れ様です有難う
>>13
どんまいケル
前スレ996さんありがとう
Team 2ch wiki内にページを作ったので、
自由に使ってくださいな。
https://team2ch.net/index.php?Folding%40home
まったりのんびり行きましょ( ^^) _旦~~ >>17
キーボードの"["と"]"で変えられるぞ 前スレで今日から参加、と書いた者です。
昔、これに似たSETIか何かに参加して癌のタンパク質か何かの解析手伝ってたんだけど、あれって結果出たんですかね? BOINCならプロジェクトの進捗は公表してるよ
他は知らんけど えらく固いのが来た、15.00 daysでBase Credit 5500な宿題はないだろ？
Project 14190って、コロナ関連でもなさそうだし >>18
実際最初の1週間は頭ほかほかしてるだろうから
もうちょっとまとめてテンプレに入れちゃいなyo >>16
918名無しさん2020/04/14(火) 11:06:19.950
創薬とスパコン https://www.r-ccs.riken.jp/jp/post-k/pi/drugdiscovery
他所で貼ってあった奴だけど、おおよそ自分達が何をしているのかが書いてあるな
これは？ >>20
電気代をスパコンに寄付するのとどっちがコスパいいのか考えてしまう 2.4EFLOPって凄いなぁ
この中に自分も入ってると考えると胸熱 コスパかあ
パフォーマンス、成果が計りずらい所があるから
寄付のコスト（とデメリット）とドナーのコスト（とデメリット）を比較してどちらが納得できるか、じゃないかな >>16
同感。
それどころか悪用されるんじゃないのかとか思ってる
全スパコンより速くなったんなら何某かの進捗が聞きたい 個人の寄付では即効性が無いっしょ
だからこそ2.4EFLOPって数値が注目もされてるんだし 開始から2週間で、200万点になりました。スローペースですが、続けようと思います。
夏場が怖い >>36
これみんな気付いてただろう
計算機でちょっと計算するだけでも
あって小学生でも思うんじゃね >>22
ベンチとしてはPPD部門とPPD/電気代部門がある感じだな 月間の電気代が5千円なら年間で6万円
マシンの劣化も考慮したら場合によれば研究機関へ寄付した方が良いという選択肢もあるで 資金を寄付することで、
(1)ソフトウェアエンジニアリングとサーバハードウェア支援 (急激なスケールアップのため特に重要)と
(2)シミュレーションによる洞察に基づいた実験のための部材購入に貢献できるそうだよ。
一人一人の貢献は小さくても数が集まれば大きな力を得るのは、マシンパワーの提供も資金の提供も同じだよ。
https://foldingathome.org/covid19/ 100ドルぐらい寄付してもいいけど前しようとしたら面倒臭い入力フォームだらけだったからやめた >>33
悪用云々まで考えると他のことだってそうだしなぁ
言い方は悪いけど、これに関して言えば、コロナをどうにかするってよりも地球規模のスコアアタック祭（参加費：電気、マシン代）ぐらいの軽い感覚でいいと思う 性質としては
・不活性なPC資源の発掘(特にゲーミング)
・電気代の寄付
上はノーコストだから意味はある
12万円のPCを新規増設して更に電気代が6万円かかるなら投資は66%カットできるわけだ ついでに2.4エクサFLOPSのスーパーコンピュータを今から設計生産してたら何にも間に合わない PCリプレースサイクル早くなっても電気代少し多くなっても国内に金落とせるからいいんじゃないかね
マシンパワーで貢献できるなら現金直寄付より多方にメリットあるかと 月5千円なら飲み代を生贄に電気代召喚でいけるさ
(家飲み捗ってるのはﾅｲｼｮw) 希望って名の壮大な遊びだよケセラセラなるようになる
まったりいきましょうよ生まれた時から死ぬ事は定めなんだから少なくとも今は(笑) 使ってない機器をシェアリング利用ってのはいいことだよな
そのおかげでエクサflopsの化け物を新規に用意するリソースが要らないわけだし 人類史上最強のコンピュータの一員さ！
若干機械化惑星のネジって気もするがw 本音はPCをアップグレードするための
口実にしてる奴が多数 >>49
グラフの一員として俺は死ぬけど
きっと「で・あ・る・く・な」自粛しろ
言われても集まって酒飲んで風俗で〆た子たちは
軽症でお薬飲んで全快して
結婚して子供いっぱい産ませるんだろうなぁ >>53
なんで噛みつかれたか分からんがが俺が言いたい事はネガるよりなる様にしかならんからワンちゃんで非力でも回そうぜって事なんだが
まったりゆるーくいきましょ( ^^) _旦~~どうぞ ハードは自分で用意するから電気代を貢献度に応じて支給してくれないかな 死ぬ前にpornhubの履歴だけは消しておかないとね >>1
スレ立て乙。
新テンプレの人もありがとう！
日報の人もにっぽつ！
Wiki編集してくれた人も乙！
レスくれた人サンクス！
>>前スレ898読んで笑っちまった。
既に2.4EFLOPS超えてて、世界のスパコントップ500の合算能力よりも上回っちゃってるとかどんだけｗｗｗ
みんなも、みんなのPCも、乙だぜコノヤロウ！！ >>56
すまん
>>58
そろそろいらないものを処分しようかな >>61
だいじょぶだぁ〜って志村が笑ってる気がする気にすんな(笑)
疲れたら一休み一休み( ^^) _旦~~ゆるーくながーくいきましょ(*´ω｀*)ｂ >>52
嫁に黙って2070Sを2ヶ月に分けて2枚買ったσ(ﾟ∀ﾟ;)
980Ti無印からの乗り換えだから電気代の調整も完璧、まだバレてない模様 FAHと出会って過去最高にIYHな気分
NAVI2枚積みたいなあ >>34
なんで即効性無いの？即効性無ければどのように役立つの？ 仮想通貨掘ってたら壊れたから躊躇する
壊れ方が動くんだけど激おそになってビデオカード変えても直らなくて
メモリ換えても直らなくて結局マザボ換えたら直ったけど 前スレにも書いてあったけど>>3と>>5の話は丸々カットできるね
次スレでは反映されてほしい >>68
すでにPCを回す分の電気代を寄付しても、その寄付した値段分のマシンをすぐに用意するの難しいっしょ？
即効性無ければ〜ってのが即効性抜きにしてって意味なら、そりゃあ2、3年かけて専用スパコンも作れるだろうし
>>42が言ってるような支援だって可能だし。
でも今はそんな年単位で待ってられない上に、同じ効果をF@HやBOINCで得られるんだから
寄付もいいけど普通にF@H回した方がマシって話。 3日つけっぱなしの低スぺCPUに宿題ふってこなくなった XeonにECCメモリ積めばそういうことは無くなる 眠っていた2015年モデルのTOSHIBA dynabook (intel Corei7 5500U)で参加することにした。
ノートPCだから電気代もそんなに気にしなくていいし。
非力だけど少しでも役立てることができれば。 午後から再起動してもCPU/GPUともに宿題が落ちてこないいぞ >>75
日に7個も宿題こなせたら十分。
そういうレベルのPCでも1000人も集まると、1年単位で見るとけっこうな違いになってくるから重要や >>76
んー、少なくとも俺は落ちて来てるからサーバー側の問題じゃないな
slot分割とかはしてみてる？ >>21>>39
お役に立ちそうでよかった
>>24
さんくす！ 今回もよくわからないまま参加してる年寄りだけど
UDの白血病を求えは結局役に立ったの？ 一週間ぶん回してポインヨ16万か…
C2Dはせつねえなあ >>82
関係してた製薬会社から薬が出たのUDじゃなかったっけ パスキー無くしたら新たに名前作って最初からやり直しですか？ 日本は今週と来週が山場だな
ここで感染者の増加を比例増加や減少に持っていけたなら、現時点と同レベルの自粛を解除しないという前提のもとかなり早く収束させられる
逆に指数関数の様相を見せるともう止められない >>86
アホがまた出歩くこともわからずに緊急事態宣言解除しそう 昨日からずっとミディアムで初めて3万くらいなんだがこんなもん？
Ryzen7 2700
GTX1660Ti >>86
山場は三週間前だろもう手遅れよ
しばらくはコロナ旋風とかライトンニングコロナだろうなぁ
外に出なくて済む人ホントうらやましい >>88
ほんと、なんであんなに自国の国民を信用できるのかわからない Overall rankがずっと0だったが、やっと数字が入った・・・ 1ペタ越えたあたりでパンデ教授が世界中には数EFLOPsの使われてない計算力があるって言ってたことを今も覚えてるけどようやくそのレベルまで来たんだな >>89
最初の10件くらいはポイント初期基礎値でボーナス無
なんだそうだ
その調子だと一日40〜50万くらいは稼げるんでない >>90
自分の生き方は自分で決めるんやで
他人に任せちゃダメ
>>94
15WU〜20WUこなさないと一気に増えないからとりあえずそこまで回してみて >>86
日本の場合、そこで曲がりなりにも微増や減少のレベルに持っていけたとして、それですぐに自粛なんて必要なかったんやーとか言い始めたり責任追及が始まったりして、せっかく規制を推進した側がバカを見るからな。補償もないから特に。 よそからこちらに引っ越ししてきました
3900X＠CPUｓ16設定とGTX1080＠PL60％設定で動かしてます、よろしくです
挨拶ついでに質問なんですが、プロジェクト的にはWU数をこなしたほうが良いんですよね？
その場合はCPUのスロットを分散（16 → 8+8）した方が良いんでしょうかね？ FOHに参加し始めてから去年の秋にパソコンを新しく組んだのは何かの巡り合わせ
に思えてきた。 GPUの餌やり用に少し空けといたら
12コア24スレなら5+5とか2*5くらいの方がGPU回ると思う GTX1080で50%で回してたが画面に時々一瞬ノイズが走るようになってしまった
再起動してから一応収まってるがそろそろまずいかな ■ このスレッドは過去ログ倉庫に格納されています
