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当の大学が同等に扱うとしても
世間一般は普通の慶応卒と同等に扱わない
学部学科名から違うから通信ってすぐバレる
例えば法学部の場合普通の通学課程だと法学部法律学科だけど
通信の場合法学部甲類っていう
成績証明書にも当然通信教育課程って記載があるから
就職活動でも通信だってことはバレる
なので通信であることを隠すつもりなら止めたほうが良い

経済的事情や家庭の事情などで通信にせざるをないというのなら仕方ないけど
普通の通学課程に進むことができるなら慶応に限らず通信はお勧めできない

Fラン大通学＞慶応通信と考えた方がいい