これまでの21世紀枠選出校

01 安積（福島） 宜野座（沖縄） 【境港工】
02 鵡川（北海道） 松江北（島根） 【八幡浜】
03 柏崎（新潟） 隠岐（島根） 【稚内大谷】
04 一関一（岩手） 八幡浜（愛媛） 【清峰】
05 一迫商（宮城） 高松（香川） 【佐賀西】
06 真岡工（栃木） 金沢桜丘（石川） 【徳之島　成章】
07 都留（山梨） 都城泉ヶ丘（宮崎） 【成章　釧路江南】
08 安房（千葉） 成章（愛知） 華陵（山口） 【五所川原農林　畝傍】
09 利府（宮城） 彦根東（滋賀） [3]大分上野丘（大分） 【身延　土庄】
10 山形中央（山形） [3]向陽（和歌山） 川島（徳島） 【新潟　防府】
11 [3]大館鳳鳴（秋田） 佐渡（新潟） 城南（徳島） 【遠軽　西都商】
12 [3]女満別（北海道） 石巻工（宮城） 洲本（兵庫） 【小松　広島観音】
13 [4]遠軽（北海道） いわき海星（福島） [3]益田翔陽（島根） 土佐（高知） 【門司学園　日立一】
14 小山台（東京） 海南（和歌山） [3]大島（鹿児島） 【角館　坂出】
15 豊橋工（愛知） [3]桐蔭（和歌山） 松山東（愛媛） 【平田　金沢商】
16 釜石（岩手） [3]長田（兵庫） 小豆島（香川） 【宇治山田　八重山】
17 不来方（岩手） [3]多治見（岐阜） 中村（高知） 【高千穂　洛星】
18 由利工（秋田） [3]膳所（滋賀） 伊万里（佐賀） 【金津　高知追手前】
19 石岡一（茨城） 富岡西（徳島） [3]熊本西（熊本） 【平田　清水桜が丘】

【 】内は補欠校　06年以降の補欠校は左が1位、右が2位
08年は全国を三分割して1校ずつ選出
09年以降の無印は東西枠、[3]は3枠目、[4]は4枠目での選出