Ls12圧縮ファイルのデコードと再エンコードは、
天翔記.jpさんのところにあるLs11 Archiver(by EMN Projects)でできました
CDSファイルの先頭をLs12からLS11に書き換えて、
拡張子をnb6に変えれば読み込めるようになりますが、
ツール自体を改造してCDSファイル(Ls12)に対応させる方が楽です
バイナリエディタでLS11ARC.exeを開き、
nb6をcdsに、LS11をLs12に、ls11をls12にすべて置換します
その際、SHIFT_JISとUTF16(LE)の両方で置換を行ってください