アラトラム号に関しては最初5000人→過酷な旅で4000人→ゴジラ討伐で600人出て行って今3400人
もう外宇宙に行く事は出来ないから話としては地球に帰還するか、全滅するかのどっちかだろう
（月面はスレで散々語られたので除外、落としどころとしても微妙）

無辜の子供もたくさん船にいるし娯楽作としては地球に入植してフツアと合流が一番可能性高いんじゃないか
もっと陰惨な終わりや破滅的なバッドエンドやるなら別だが