合い鍵使って部屋を点検されるのは違法ではないと思う。何か具体的な被害があって、それが管理人によるものだと示せるのなら別だろうけどね。
これが嫌なら自分で部屋を借りれば済むわけだし。点検がないと部屋をとんでもなく汚くする馬鹿や火事を起こす馬鹿が出るからね。会社としても仕方ないんだよ。