>>155
mksss.plの89〜92行目ぐらいの
&update($index,$constants_code{$index->encoding()},\%StorageDB,\%ModifiedDB,\%TitleDB,$_);
と
print "新規: $i / @{[$#new + 1]} $_ \n";
を入れ替えて実行すると、どのファイルが問題なのか判るかと思います。