金箱はR6ve、R5vpのミッションで出やすく、銀箱はR5以上のvevpが出やすい
金銀箱は熱砂の暴君、暴君再び、怪草討伐がトレハンマップとしてよく使われる
銀箱でもいいなら夜想ソロ
箱の出現位置は一部のミッションならwikiに書いてあるので見てみるといいかも
ちなみに期間限定ミッションのクリスの対魔訓練がある時は最下層まで行けば各宝箱が3つずつある

暴君系みたいに下位ミッションクリアにプラスして総合スコアで開放されるミッションもある
今はあまたんの気まぐれでスコアupイベント中だから
エンチャ掛けて根詰めない程度にスコア稼ぐといい

追記で鍵はギアシュのハズレ、小さな箱はクリポンからたまに出る
さらにリアルマネーで鍵がみみっくんのとこで買えるが…万人向けじゃない