それ以前に塗り潰しが雑すぎるってのは置いといて
減色した時に中間色で補完されてるせい
自分はbmp形式にしてペイントでちまちま塗りつぶしてる
昔からこれでやってるから他のやり方知らない
あと透過させたくない部分まで透過されてるから背景を全く別の色で塗りつぶした方がいい