どこかからダウンロードも出来るのかもしれませんが、

atlas.exeと同じディレクトリ内にあるMap.exeを起動すると、
atlasが使用する地図画像はフライトギアのシーナリデータを元に自動で作成されます。

http://atlas.sourceforge.net/index.php?page=run
↑の真ん中あたりにMap.exe使用法が書いてありますが・・・・・

もしフライトギアで全世界のシーナリデータをすでに展開してあるとなると、
そのままMapを起動していいものかどうか、考えると恐ろしい。
自分は日本近辺しかシーナリを入れてませんが、
それだけでも画像生成完了にはだいぶ時間がかかった気がしました。