>>862
こもるというだけでは状況がわからないです。
交換したスピーカーの型番とツィーターの設置方法を詳しく教えてください。
またヘッドユニットのトーンコントロールはフラットに戻し、ラウドネスはOFFにして
低音がスッキリしないならアンプのドライブ能力が不足しているのかもしれません。

純正のヘッドですか?
TOYOTAの廉価版ヘッドには妙な音質チューニングされているのもあるので注意が必要です。
少なくとも吸音材を入れてこもることはありません。