簡単に言うと1時間出し続けられるパワーがFTPであって20分最高とは別。
きちんと測れば20分最高>FTPになると思うけど、現時点では測れてないってことじゃないかな?
とにかく、一度きちんと計測すべし。

ちなみに「20分全力の95%をFTPとする」としたい時はウォームアップと短時間全力をこなした上で20分回し切らないと意味ないので注意。