宮崎勤は1962年8月21日、東京都西多摩郡五日市町（現在のあきる野市）小和田で、地域紙『秋川新聞』を発行していた「新五日市社」を経営する、裕福な一家の長男として出生した[6]。勤の実家は五日市町小和田181番地（座標）に所在していた[1][2][3]。両親は共働きで多忙なため、生まれてまもなく子守りの男性[注 1]を住み込みで雇い入れている[7]。幼少期の勤を、ほとんどこの男性と祖父が面倒をみていた[8]。

宮﨑家は、曽祖父が村会議員、祖父が町会議員を務めるなど地元の名士であった[9]。家族は祖父、祖母、両親、妹2人の7人である[9]。祖父は引っ込み思案な勤を連れて歩き、かわいがっていた[10]。

勤は幼い頃から手首を回せず手のひらを上に向けられない「両側先天性橈尺骨癒合症」[11]に罹患し、当時は日本で症例が150程度の珍しい身体障害があったが、医者から「手術しても100人に1人くらいしか成功しない。日常生活に支障がないなら、手術するにしても、もっと大きくなってからの方がいいだろう」と言われ、両親は「勤は幼いころから掌が不自由なのを気にしており、うまくいかないことを、掌のせいと考えてきたとされる。4歳のときに手術も考えたが、もし、手術して身障者のレッテルを張られたら、勤の将来に悪い結果となると判断し、そのままにした」と、積極的な治療を受けさせなかった[12]。そのため、幼稚園ではお遊戯や頂戴のポーズもできず、周囲からからかわれても幼稚園の先生は何も対応しなかったため「非常に辛かった」と供述している[13]。

宮﨑の父は仕事ばかりで家庭を顧みない無責任な父だったという。宮﨑の母は姑と折り合いが悪く、常に勤の子育てを廻って陰湿な対立をしていたという。宮﨑の母親は常に世間体を優先していたため、勤に愛情を全く注がなかった。